Felekezeti hovatartozásra való tekintet nélkül az önkormányzat minden egyházat és egyházközséget támogat Sepsiszentgyörgyön és a hozzá tartozó településeken: Szotyorban és Kilyénben.
Az anyagi segítség legtöbbször a templomok javítását, felújítását célozza, de rendezvényeket, emlékjelek állítását is finanszírozzuk. 2009-ben például a holokauszt háromszéki áldozatainak emlékére avattuk fel az Emlékezés Falát, majd 2014-ben, a deportálás 70. évfordulóján emlékparkot létesítettünk a zsidó temetőben.
2014-ben Sepsiszentgyörgy volt a házigazdája a 7. Magyar Református Világtalálkozónak. Kilyénben az unitárius templom falfestményeinek restaurálását támogattuk. A 3500 hívet számláló, 11 éves Krisztus Király római katolikus egyházközség svájci orgonát vásárolt az önkormányzat támogatásával. A mindennapi hitélet megfelelő körülmények közötti gyakorlásához elengedhetetlen munkálatokra, tetőjavításra, fűtésrendszeri problémák orvoslására, fő javítási munkálatokra kapott pénzt többek között az unitárius egyházközség, a szotyori református egyházközség, az evangélikus-lutheránus felekezet, a Szent Gellért Római Katolikus Plébánia, a belvárosi református templom, a szemerjai református egyházközség, a Buna Vestire ortodox egyházközség.
Új istenháza is épült jelentős önkormányzati támogatással és közösségi összefogással: a Gyöngyvirág utcai református templom alapkövét 2011-ben tettük le, majd hat év múlva, 2017-ben kerül sor a felszentelésére, a hagyományoknak megfelelően: keresztelővel.
Az önkormányzat és a város gyülekezetei közötti eredményes együttműködés egyik gyümölcse az új gyülekezeti ház és lelkipásztori lakás, amelyet a vártemplomi református egyházközség 2018 augusztusában hálaadó istentiszteleten avathatott fel. A hely szelleméhez méltóan reformációs emlékfalat is állítottak, amelyen református erdélyi fejedelmek – Bethlen Gábor, Bocskai István, I. Rákóczi György – domborművei láthatók, annak pedig a gyülekezet legkisebb tagjai, a gyermekek örülhetnek, hogy az új épületek közelében, a gyümölcsöskertben játszótér is épült.